交通部因應嚴重特殊傳染性肺炎（COVID－19）疫情，協調各國際機場計程車自律委員會成立防疫車隊，以降低居家檢疫者返家之防疫風險。經審計部交通建設審計處查核發現，民用航空局（下稱民航局）高雄國際航空站（下稱高雄機場）防疫車隊未落實駕駛健康監測措施，經函請民航局督導檢討改善，已加強防疫車隊出車前健康監測管理，以有效降低疫情傳播風險。
審計處指出，嚴重特殊傳染性肺炎中央流行疫情指揮中心（下稱疫情指揮中心）鑑於車站、候車地點及大眾運輸工具等屬公眾使用且多為密閉空間，長時間且近距離可能增加呼吸道傳染病之傳播風險，於109年1月29日訂定「嚴重特殊傳染性肺炎」（武漢肺炎）因應指引：大眾運輸（下稱大眾運輸因應指引），以強化防疫措施。依據指引規定，應訂定駕駛及服務等工作人員（含流動人員）健康監測計畫，並有異常追蹤處理機制。另疫情指揮中心於110年6月27日宣布，因應Delta變異株於全球擴散，旅客入境應搭乘機場防疫車隊前往集中檢疫所或防疫旅宿，減少病毒傳播風險。
然而，審計處於110年9月查核發現，高雄機場防疫車隊未依大眾運輸因應指引，訂定防疫車隊駕駛健康監測計畫（含異常追蹤處理機制），審計處遂於111年1月函請民航局督導檢討改善。
審計處表示，經追蹤改善情形，高雄機場已加強防疫車隊出車前健康監測管理，駕駛出車應量測體溫及填寫清消紀錄，並增加駕駛健康監測之查核，且將防疫車隊列入營運計畫之人員健康管理對象，以有效降低疫情傳播風險。