苗栗縣政府衛生局(下稱衛生局）所屬部分衛生所辦理醫療獎勵金發給作業，經審計部臺灣省苗栗縣審計室查核發現，其績效評核及獎勵金計發作業未依規定辦理，相關作業規範亦未臻周延，經函請研謀改善，已督導各該衛生所視人員實際出勤狀況核發獎勵金，並訂定「苗栗縣政府衛生局所屬衛生所人員獎勵金發給規定」供各衛生所遵循，維護獎勵金發給之公平性。
審計室指出，衛生局為鼓勵衛生所人員提高服務品質及醫療水準，訂有「苗栗縣政府衛生局所屬機關獎勵金發給規定及績效評核原則」供所屬衛生所依門診醫療辦理成效合理分配獎勵金，109年度計有苗栗市等9個衛生所支領獎勵金，金額共計3,529萬餘元。
然而，審計室於109年9月查核發現，上開衛生所辦理獎勵金發給作業，間有醫療獎勵金發給作業未盡周妥，且對於獎勵金計發標準尚乏明確規範，審計室遂於109年11月函請衛生局研謀改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，衛生局已督導衛生所視人員實際出勤狀況依規定核發獎勵金，並於110年10月15日訂定「苗栗縣政府衛生局所屬衛生所人員獎勵金發給規定」，明確規範所屬衛生所醫師與人員出缺勤之獎勵金計發標準，及各科別醫療門診服務之獎勵金分配原則，並強化衛生所績效評估委員會功能，維護獎勵金發給之公平性。