臺南市政府地政局(下稱地政局)為保管歷年因受領遲延、拒絕受領或不能受領之徵收補償費，設立土地徵收補償費保管專戶，經審計部臺南市審計處查核發現，截至108年底止，保管專戶未受領之徵收補償費達13億227萬餘元。為確保被徵收土地所有權人權益，經函請該局研謀改善，已於網站建置「徵收補償費保管款查詢系統」，供民眾透過姓名或身分證統一編號查詢未領之補償費，維護民眾權益。
審計處指出，土地徵收係政府為興辦公益事業需要，基於國家對土地之最高主權，依法定程序，強制取得特定私有土地並給予相當補償之一種處分行為。依土地徵收條例第20條及第26條規定，直轄市主管機關依規定於徵收公告期滿後15日內發放徵收補償費，並於國庫設立土地徵收補償費保管專戶，保管因受領遲延、拒絕受領或不能受領之補償費；逾15年未領取之補償費，歸屬國庫。
然而，審計處於109年3月查核發現，截至108年底止，地政局保管歷年民眾未受領之徵收補償費計1萬2千餘件，金額達13億227萬餘元，其中單筆補償費金額逾500萬元者計有25筆，最高金額為3,308萬餘元；106至108年度因受補償人逾15年未領而解繳國庫之補償費合計4,569萬餘元，另該局土地徵收專區網站僅公告件數及金額，不利民眾查詢，審計處遂於109年5月函請地政局研酌改善。
審計處表示，經追蹤改善情形，地政局已於110年11月在該局網站「地政專區\土地徵收專區\補償費領取」建置「徵收補償費保管款查詢系統」，供民眾透過姓名或身分證統一編號查詢未受領之徵收補償費，並於該局網站、各地政事務所及新聞媒體廣為宣導，加速民眾申領歷年未受領之徵收補償費，維護民眾權益。