澎湖縣政府建置電子申辦服務系統，提供民眾線上申辦服務，經審計部臺灣省澎湖縣審計室查核發現，線上申辦服務項目及案件量能尚待提升，經函請檢討改善，截至110年7月底可供線上申辦(預約)項目由85項提升至159項，109年度及110年1至7月之申辦件數較108年度之52件，增加逾22倍及6倍，大幅提升線上申辦服務成效。
審計室指出，澎湖縣政府為使民眾透過網際網路，完成線上申辦、預約及查詢服務案件進度，提供便民服務措施，於106年5月間投入500萬元建置電子申辦服務系統，將各機關（單位）業務之申辦項目登載於該系統，計有602項（分屬30個機關單位），其中可供線上申辦(預約)項目計85項，約占14.12％。
然而，審計室於108年10月查核發現，截至108年8月底止，線上申辦會員使用服務之案件數僅32件，且有11個機關（單位）未提供線上申辦(預約)服務，申辦項目之類型尚未多元化，審計室遂於108年11月函請檢討改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，澎湖縣政府已於109年10月間辦理為民服務講習，推動線上申辦服務，促請各機關(單位)通盤檢討線上申辦項目，並提供非會員登錄使用，及導入個人化資料自主運用(MyData)之線上介接服務，免提供紙本資料，截至110年7月底止，可供線上申辦(預約)項目由85項提升至159項，約1.87倍，109年度及110年1至7月之申辦件數較108年度之52件，增加逾22倍及6倍，線上申辦服務大幅提升，有效落實便民服務措施。