臺北自來水事業處（下稱北水處）經管之土地，經審計部臺北市審計處查核發現，間有未發現土地遭占用情形，經函請檢討改善，業與占用人協商取得返還共識，或已由占用人騰空返還，或向占用人收取土地使用補償金及租金，維護市府權益。
審計處指出，北水處經管土地包含臺北市市有及國有土地等，按臺北市市有財產管理自治條例第17條、第99條規定，財產管理機關對其管理之市有財產有被占用者，應即依法訴追及追收最近五年占用期間之使用補償金，並應隨時注意所經管房地之保管使用狀況及有無被占用；又各機關經管國有公用被占用不動產處理原則第6點規定略以，管理機關應規定向占用者追溯使用補償金，訴訟請求排除占用前，占用者騰空返還者，免收補償金。
然而，審計處於108年10月查核時，運用地理圖資軟體（QGIS），套疊北水處提供土地清冊與內政部國土測繪中心公告地籍圖、臺灣通用電子地圖等圖資，並進行資料清理與分析，發現北水處經管部分土地疑遭不明建物占用，或他人建物有超過該處土地地籍線等情，審計處遂於109年1月2日函請北水處檢討改善。
審計處表示，經追蹤改善情形，截至110年1月底止，北水處已確認前揭遭占用案件計9案，除1案業由北水處於109年12月與占用人取得返還共識擇期拆遷外，其餘8案已由占用人騰空返還，或向占用人收取土地使用補償金及租金計235萬餘元;另為免類此情事再發生，已研擬加強內部房地管理實務教育訓練、自主房地巡查作業等改善措施，以維護市府權益。