臺北市政府(下稱市政府）轄管財團法人監督情形，經審計部臺北市審計處抽查發現，該府未於財團法人法施行後，訂定違規案件裁罰基準，影響業務之遂行，經函請檢討改善，業已研訂統一裁罰基準。
審計處指出，政府為健全財團法人組織運作，促進財團法人積極從事公益，增進民眾福祉，於107年8月制定公布財團法人法，並自108年2月1日施行。截至108年底止，市政府轄管財團法人(不含宗教財團法人)計有682家，基金總額168億餘元，依據財團法人法第3條第1項及臺北市財團法人管理規則第2條等規定，臺北市財團法人之主管機關為市政府，臺北市財團法人之設立許可、撤銷或廢止許可及監督管理等相關事項，由所屬各目的事業主管機關辦理。
然而，審計處108年12月間查核發現，市政府部分主管機關為健全財團法人組織及運作，雖已依據該法陸續函告久未正常運作法人，應於期限內檢送相關營運及運作資料審查，屆期未改善者將依法裁罰，惟至108年底止，該法施行已逾10個月，市政府尚未針對違法案件訂定統一裁罰基準，各主管機關亦尚未依前開管理規則自行擬定相關規範，以為執行裁罰業務之準據。由於該府轄管財團法人以教育、文化及社會面向居多，其運作成效及管理良窳，攸關社會教育文化品質提升或公益服務量能，經於109年2月10日函請檢討改善。
審計處表示，經追蹤改善情形，市政府業於109年10月29日訂頒「臺北市政府處理違反財團法人法事件統一裁罰基準」，並自109年10月30日生效，以建立執法公平性。