審計部所屬地方審計處室檢視各鄉鎮市及山地原住民區108年度總預算，發現有部分預算編列項目與法令規定未盡相符等情事，經審計機關促請檢討改善，另建請行政院主計總處督促各該市縣政府加強辦理鄉鎮市及山地原住民區預算編列及執行情形之考核。業於辦理追加(減)預算時減列或凍結相關經費支出，以維護地方財政秩序與紀律。
108年度臺灣省11縣及福建省金門、連江2縣等13縣所轄198個鄉鎮市，綜計編列歲(收)入預算575億2,455萬餘元、歲(支)出預算614億6,386萬元；另4直轄市所轄6個山地原住民區，綜計編列歲入預算15億9,120萬餘元、歲出預算17億7,701萬餘元。經審計部地方審計處室檢視各鄉鎮市及山地原住民區108年度預算編列情形，發現有部分預算編列項目與法令規定未盡相符等情事，計有13市縣所轄164鄉鎮市區共414項，業經審計部相關地方審計處室函請各該管市縣政府，依地方制度法規定本自治監督權責督促鄉鎮市及山地原住民區公所妥適處理；另經審計部於108年5月23日建請行政院主計總處督促市縣政府加強辦理所轄鄉鎮市及山地原住民區預算編列及執行情形之考核，以健全地方預算之控管。
案經行政院主計總處於108年5月31日函請各該市縣政府加強督促所轄鄉鎮市及山地原住民區公所依規定檢討改進，嗣後避免類此缺失重複發生，並將連續3年度未改善者列為重點查處對象，及配合調整管控機制；另歲入歲出差短仍編列赴國外或大陸地區預算部分，應加強開源節流與視自身財政能力檢討編列預算。嗣經審計部地方審計處室追蹤改善情形，截至108年12月底止，各該公所已於追加(減)預算時減列或凍結相關經費支出計916萬餘元，並持續控管預算編列情形。