審計部臺灣省彰化縣審計室(下稱彰化縣審計室)查核發現，彰化縣政府辦理舊濁水溪畜殖餘肥再生綠金先導研究計畫，未依規定辦理用地變更即逕於農牧用地建置廢水處理場及營運，且場區放流水未符相關環保標準，影響土地使用管制及鄰近農業生產環境，經審計機關促請研謀改善，已拆除廢水處理場，土地恢復原狀並移交由財政部國有財產署接管，有效維護毗鄰農業生產環境。
彰化縣政府為改善舊濁水溪水質，於101年4月間發包辦理舊濁水溪畜殖餘肥再生綠金先導研究計畫，同年8月經行政院核准撥用溪湖鎮顯光段840及841地號等2筆國有土地，使用分區屬非都市土地特定農業區農牧用地，並於土地上建置廢水處理場1座，工程於102年1月完工，同年5月正式營運，累計投入經費2,442萬餘元。彰化縣審計室於105年12月查核發現，該府於非都市土地特定農業區農牧用地設置廢水處理場，為節省取得建築許可時程，未依規定辦理用地變更，逕以籌設畜牧設施方式申請建置及運作，涉有違反區域計畫法相關規定，後續雖申請農地變更使用以符規定，惟行政院農業委員會於104年5月26日核退其申請，迄未能完成用地使用合法化，且放流水亦未符相關環保標準，影響土地使用管制及鄰近農業生產環境，經於106年7月14日函請研謀改善。
嗣經彰化縣審計室追蹤改善情形，該府評估廢水處理場屬違規建物，且放流水未符相關環保標準，持續營運未符預期效益，已於107年2月23日拆除廢水處理場，恢復原狀；另使用土地經行政院分別於107年12月4日及109年4月22日核准廢止撥用，並移交由財政部國有財產署接管，有效維護毗鄰農業生產環境。