審計部臺南市審計處(下稱臺南市審計處)查核發現，臺南市政府衛生局(下稱衛生局)雖已每年辦理夜市攤販衛生稽查及食品抽驗，惟未規劃輔導夜市攤販申請食品業者登錄，不利食品追蹤管理，經促請研謀改善，該局已輔導9百餘家業者完成登錄，落實食品安全管理，維護民眾飲食衛生安全與健康。
夜市是民眾接觸頻繁之生活圈，亦為地方重要觀光景點。衛生福利部為確實掌握食品業者資訊，落實食品追蹤與管理，訂頒「食品安全衛生管理法」及「食品業者登錄辦法」等規定，規範食品製造、加工、輸入、輸出、販售及餐飲業者，包括夜市攤販等，應向中央或直轄市、縣（市）主管機關申請登錄，始得營業。臺南市審計處於107年10月間查核發現，臺南市許可設置之夜市計有永康區中興里夜市等10處，衛生局雖每年辦理夜市攤販衛生稽查及食品抽驗，惟未規劃輔導夜市攤販完成食品業者基本資料之登錄，無法確實掌握食品業者資訊，落實對業者之輔導與稽查管理，經於107年12月函請衛生局研謀改善。
嗣經臺南市審計處追蹤改善結果，衛生局已會同臺南市市場處針對夜市業者辦理講習課程，並至夜市現場辦理登錄駐點服務，輔導協助業者申請登錄作業，且加強查處未登錄食品業者。截至109年1月底止，已輔導轄內夜市867家餐飲業者及48家販賣業者完成登錄，有效掌握食品業者資訊，落實食品安全管理，維護民眾飲食衛生安全與健康。