審計部臺灣省雲林縣審計室(下稱雲林縣審計室)查核發現，雲林縣稅務局(下稱稅務局)辦理地價稅及房屋稅稽徵作業，部分課徵田賦之土地，非供作農業用途，未改課地價稅；且坐落於上開土地之房屋，漏課房屋稅，經促請檢討改善，已依法補徵稅款，維護租稅公平。
土地稅法第14條規定，已規定地價之土地，除課徵田賦者外，應課徵地價稅；房屋稅條例第3條及第7條規定，房屋稅，以附著於土地之各種房屋，及有關增加該房屋使用價值之建築物，為課徵對象，納稅義務人應於房屋建造完成、增建、改建及變更使用之日起30日內檢附有關文件，向當地主管稽徵機關申報房屋稅籍有關事項及使用情形；財政部賦稅署80年11月28日函釋，原屬符合土地稅法第22條規定課徵田賦之土地，部分變更為非農業用地使用，依法應改課地價稅者，應按其實際使用面積，分別課徵田賦及地價稅。雲林縣審計室於106年10月間運用電腦稽核軟體及地理圖資系統，勾稽查核稅務局之地價稅、房屋稅等相關課稅資料，發現部分課徵田賦之土地，已變更為製造業、商業或倉儲等非農業用途使用，惟未依法改課地價稅；部分坐落於上開土地之房屋，查無房屋稅籍資料等情事，經於106年12月15日函請檢討改善。
嗣經雲林縣審計室追蹤改善情形，稅務局已自107年1月至108年8月底止，執行清查並釐正稅籍資料，落實稅源掌握，補徵地價稅及房屋稅計1,356件，金額2,677萬餘元，並加強宣導與運用資訊科技辦理地價稅及房屋稅清查作業，以維護租稅公平。