審計部查核發現，食品安全衛生管理法(下稱食安法)要求食品業者應辦理登錄始得營業，並每年確認申報內容，以協助衛生主管機關掌握食品業者動態資訊，作為食安管理重要資訊，惟因小型食品業者法規認知不足，登錄作業亦未盡友善便民，致半數業者未於規定期限內完成年度登錄確認作業，經函請食品藥物管理署(下稱食藥署)研謀改善，並研議採行簡易登錄及多元認證之作法。該署已新增健保卡及書面等管道供業者進行登錄或確認，以達簡政便民之效。
食藥署為健全我國食品安全管理制度，掌握食品業者動態，於民國(下同)102年6月19日修正食安法要求食品業者應辦理登錄始得營業，每年7月並應至該署非登不可平臺再確認其登錄內容，以維護食品業者登錄資料之正確性，作為食安管理重要資訊。惟審計部查核發現，小型食品業者受限於法規認知、資訊能力較為不足，加以登錄憑證採用工商憑證或自然人憑證，申請作業繁瑣不便，自行完成登錄確認作業難度高，致半數業者未於規定期限內完成，須仰賴地方衛生主管機關投入大量人力輔導後，每年年底前確認率方可達成9成，顯見登錄制度設計未盡友善便民，經於107年6月函請食藥署研議簡易登錄與多元認證之可行性，以達簡政便民之效。
嗣經審計部追蹤改善情形，食藥署除持續向業者加強宣導外，並分別於108年2月及3月，新增以健保卡進行登錄，或採書面方式進行年度確認作業，期以多元管道提供業者便民服務。