審計部臺灣省彰化縣審計室(下稱彰化縣審計室)查核發現，彰化縣環境保護局(下稱彰化縣環保局)未依東西二、三圳附近監測站之水質監測結果，加強檢視灌溉系統污染負荷，並有效管制污染源總量範圍，又對於轄內事業廢水排放情形，未能加強稽查深度並予裁罰，無法有效遏止業者違法偷排廢水，致附近水體及土壤遭受污染，經促請檢討改善，已擴大污染管制範圍並落實稽查及污染整治，有助於維護及改善環境品質。
依據水污染防治法第3條、第7條及第26條規定，縣（市）政府對於事業廢水處理情形有稽查之責，並得視轄區內環境特殊或需特予保護之水體，就排放總量或濃度等，增訂或加嚴標準。彰化縣審計室於民國(下同)104年9月間查核發現，東西二、三圳附近部分監測站，銅、鎳等重金屬濃度監測值為0.28至4.76毫克/公升，高於灌溉用水水質標準，彰化縣環保局並未加強檢視灌溉系統污染負荷量，依前揭規定有效管制污染源，復辦理轄內事業廢水處理稽查，未能深入查察業者廢水處理程序有無異常，並蒐集足夠違規證據，據以提高裁罰金額，無法有效嚇阻業者違法偷排廢水，致附近水體及土壤遭受嚴重污染，農民被迫休耕，損及耕作權益，經先後於104年12月、105年5月間函請檢討改善。
嗣經彰化縣審計室追蹤改善情形，彰化縣環保局已於107年9月修正東西二、三圳管制範圍，由13.56平方公里擴大至66.75平方公里，並落實辦理深度稽查及污染整治，取締偷排廢水裁罰金額亦由105年度之6,757萬餘元，增加至107年度之1億14萬餘元，有效嚇阻違法行為。又偷排廢水案件已由105年度之239件，減少至107年度之177件；農地污染控制場址面積，則由105年底之231.41公頃，減少至107年底之216.46公頃，有助於維護及改善環境品質。