審計部臺灣省新竹縣審計室(下稱新竹縣審計室)查核發現，新竹縣家畜疾病防治所流浪犬隻人道處理率偏高，尚待建置與業者結盟等多元媒合管道，經促請檢討改善，已成立認養網站積極辦理犬隻媒合工作，提升收容成效，減少人道撲殺。
依動物保護法第12條規定，收容於動物收容處所或市縣主管機關指定場所之動物，經獸醫師檢查患有法定傳染病、重病無法治癒、嚴重影響環境衛生之動物或其他緊急狀況，嚴重影響人畜健康或公共安全，得予宰殺；行政院農業委員會(下稱農委會)公布自民國(下同)106年2月4日起，全國公立動物收容所全面停止人道撲殺；政府則必須採行多元認養及改善收容等配套措施，以降低收容所收容壓力，並達到保護動物目標。新竹縣審計室於106年4月查核發現，新竹縣家畜疾病防治所103至105年度流浪動物認領養率雖已由54.16％提升至81.67％，惟105年度總收容數1,866隻，人道處理數250隻，人道處理率仍達13.40％，有違農委會保護動物之目標，經於106年4月25日函請檢討改善。
嗣經新竹縣審計室追蹤改善情形，新竹縣家畜疾病防治所已於106年6月間於新竹縣動物保護資訊網增設寵物認養相關講座及補助專區，積極宣導辦理犬隻認領養媒合作業，期減少人道撲殺。據農委會統計，截至106年12月底，該所認領養率已提升至95.83％，另107年1至6月犬隻總收容數197隻，已辦理認領養計146隻，且無人道撲殺件數，收容成效已提升，並符合保護動物之目標。