審計部嘉義市審計室(下稱嘉義市審計室)查核發現，嘉義市政府財政稅務局(下稱財政稅務局)辦理房屋稅稽徵作業，部分房屋查無營業人設籍，仍按營業用房屋稅率課徵，未適用較低之住家或非住非營稅率，影響納稅義務人權益，經促請檢討改善，已依法改課，民眾每年減少繳納房屋稅款33萬餘元，並於嗣後加強清查釐正稅籍。
依嘉義市房屋稅徵收率自治條例第2條規定，住家用房屋：供自住或公益出租人出租使用者，為其房屋現值1.2％；其他供住家用者，為其房屋現值1.5％；非住家用房屋：供營業、私人醫院、診所或自由職業事務所使用者，為其房屋現值3％；供人民團體等非營業使用者，為其房屋現值2％。嘉義市審計室於民國(下同)106年10月請財政稅務局提供房屋稅徵收檔、課稅主檔、課稅統計歷史檔、房屋座落資料檔等，與財政部南區國稅局提供營業稅籍主檔勾稽結果，發現部分房屋面積課徵營業用房屋稅率，查無營業人設籍者計362筆，核與上揭規定未合，經於107年1月17日函請檢討改善。
嗣經嘉義市審計室追蹤改善情形，自107年1月至4月3日止，經財政稅務局查處結果，112筆房屋確實無營業人設籍，係因納稅義務人未依房屋稅條例第7條規定於房屋建造完成之日起30日內向該局申報房屋使用或變更使用等情形，已自107年2月起改按住家用或非住非營稅率核課，民眾自107年度起每年減少繳納房屋稅款共計33萬餘元。另該局並於嗣後透過多元管道向民眾宣導租稅法令，蒐集國稅局遷移及註銷商號主動勘查加強釐正作業，維護民眾權益。