審計部查核發現，政府依法得於疫病大流行發生時，徵用公共場所設立大型隔離收治場所，惟各市縣大型隔離收治場所設置規劃詳簡程度不一，恐影響即時因應疫情發生時大量感染病患之隔離需求，經函請疾病管制署研謀改善。該署已訂定大型隔離收治場所設置規劃原則及相關檢核表，以完備相關準備工作。
我國傳染病防治醫療網劃分為6個醫療網區，各區設置1家網區應變醫院優先收治第一、五類法定傳染病及新興傳染病病患，一旦疫情擴大超過應變醫院收治量能，且經徵用醫療機構仍無法收治病患時，中央流行疫情指揮中心得依傳染病防治法第53條規定徵用公共場所開設為大型隔離場所收治病患，平時各地方衛生局並應提報隔離場所名冊供疾病管制署備查。審計部查核發現，全國22個市縣提報之民國（下同）105年度流感大流行準備相關計畫中，對於大型隔離場所設置規劃詳簡程度不一，部分規劃內容未盡完備，甚或尚乏隔離場所設置相關規劃，恐影響即時因應疫情發生時大量感染病患之隔離需求，經函請疾病管制署檢討改善。
嗣經審計部追蹤改善情形，疾病管制署已於106年12月訂定「大型隔離收治場所設置規劃原則」及相關檢核表，並辦理傳染病防治醫療網大型隔離收治場所規劃教育訓練，將持續輔導及督促地方政府衛生單位確實落實隔離場所相關規劃，以完備相關準備工作，維護國人生命健康。