審計部臺南市審計處(下稱臺南市審計處)查核發現，臺南市政府衛生局(下稱衛生局)未積極督促衛生所開設戒菸門診及醫護人員教育訓練，影響菸害防制成效，經促請研謀改進。各衛生所均已開設戒菸門診，督促醫護人員參與高階衛教師及醫師戒菸治療教育訓練課程，民眾接受戒菸服務人數大幅增加，有效維護民眾身體健康。
根據衛生福利部公布民國(下同)105年度國人十大死因，第1名為癌症，又以肺癌死亡人數最多。衛生局為維護民眾身體健康，105年度編列菸害防制計畫預算1,860萬餘元，辦理各項菸害防制工作，要求轄屬37區衛生所開設戒菸門診，提供民眾戒菸衛教或藥物治療服務。臺南市審計處105年9月查核發現，37區衛生所中，尚有東區等3區衛生所未開設戒菸門診；歸仁等12區衛生所因護理人員未取得高階衛教師資格，而未能提供戒菸衛教服務；安平等3區衛生所因醫師未參加戒菸治療教育訓練課程，而未能取得提供藥物治療資格，影響戒菸工作推動，經於105年12月函請衛生局研謀改善。
經臺南市審計處追蹤改善結果，臺南市東區等3區衛生所均已開設戒菸門診；衛生局並已督促上開衛生所醫護人員積極參與訓練課程，106年度截至9月底，計59人已參與高階衛教師或戒菸治療教育訓練課程。各衛生所辦理戒菸衛教及藥物治療服務民眾計898人，較105年同期之267人，增加631人(增幅236.33％)，維護民眾身體健康。