審計部臺南市審計處(下稱臺南市審計處)查核發現，臺南市政府教育局(下稱教育局)為保障裁併校區學童就學便利，提供免費交通車接送上下學服務，惟查部分裁併校區至新學校間已有幹線公車行駛，核有不經濟支出情事，經函請教育局檢討提供交通車之必要性。該局已與臺南市政府交通局(下稱交通局)協商調整公車時段或班次，學生上下學時段由專責人員隨同學生搭乘免費公車，以確保裁併校區學童搭乘公車之安全，並節省接駁車費用及提升公車載客率。
依國民教育法施行細則第2條規定略以：交通不便、偏遠地區或情況特殊之地區，直轄市、縣(市)政府視實際需要提供上下學所需之交通工具或補助其交通費。教育局為保障裁併校區及情況特殊學校之學童就學便利，補助裁併校區交通車租賃費，接送學生上下學。臺南市審計處於民國(下同)104年9月查核發現，該局104年度計核定補助17間裁併校區交通車租賃費及隨車人員經費1,671萬餘元，接送306位學童上下學，惟其中5間裁併校區與新學校間已有公車路線，是否仍有必要提供交通車接送上下學，經於104年12月函請教育局檢討改善。
嗣經臺南市審計處追蹤改善結果，教育局已與交通局協調調整公車時段或班次，並配合學校及家長意願、兼顧學童權益及安全之前提下，新化國小及鹽水國小分別自105學年度第1學期及第2學期開始試辦裁併校區學童搭乘公車通學，計接送23位學童上下學，2校學童除持學生卡享有搭乘臺南市幹線公車基本里程8公里免費之優惠外，上下學時段指派專責人員陪同學童上下學，善用大眾交通工具，每年約可節省167萬元交通費補助，並提升臺南市公車載客率。