審計部臺南市審計處(下稱臺南市審計處)查核發現臺南市部分區公所未落實清查列管範圍之空地空屋數量，未依登革熱疫情擴散程度適時調整列管範圍，督促空地空屋所有權人善盡清理義務，影響登革熱防疫成效，經函請臺南市政府民政局檢討改善後。該局已督導區公所全面清查空地空屋造冊列管及擴增列管範圍，並修正相關考核計畫，強化空地空屋管理，杜絶病媒蚊孳生，民國(下同)105年1至7月臺南市本土登革熱病例已較104年同期大幅減少。
臺南市政府為有效管理空地空屋，改善環境衛生，維護市容景觀，由各區公所依臺南市空地空屋管理自治條例劃設實施區域範圍，清查空地、空屋數量，造冊列管並查報違規事項。截至104年9月底，臺南市列管空地7,477筆，面積943.272公頃，空屋2,306棟，投入937萬餘元及5,413次人力辦理空地整理維護。臺南市審計處查核發現，新營等31區列管之空地面積641.54公頃尚不及各該區劃設實施區域空地面積53,367.30公頃之10％，且多數區公所僅就認養或代管之空地列管，未落實清查劃設範圍內之空地空屋，而乏人清理，易形成防疫漏洞；又新營等4區公所在登革熱疫情嚴重期間，未視登革熱疫情擴散程度適時調整空地空屋管理施行範圍，督促所有權人善盡清理義務，影響登革熱防疫成效，經通知臺南市政府民政局檢討改善。
嗣經臺南市審計處追蹤後續改善情形，民政局已督導各區公所全面清查空地空屋並造冊列管，截至105年3月止列管空地11,312筆，面積1,769.508公頃，增加約87.59％，空屋3,614棟，增加約56.72％；105年4月27日修正空地維護管理考核計畫，加強考核各區公所空地空屋管理成效；新營、新化區業於105年7月20日公告將全區劃設為實施區域範圍，歸仁、下營及南化區亦擴大施行面積計15,758.72公頃，以強化空地空屋管理，並定期巡檢所有權人清理情形，杜絶病媒蚊孳生。105年1至7月臺南市本土登革熱計15病例，較104年同期217例大幅減少93.09％。