審計部臺北市審計處(下稱臺北市審計處)查核發現，臺北市政府工務局新建工程處(下稱新工處)辦理北投士林科技園區區段徵收公共工程(第1期)，廠商第一階段逾期完工時未依約暫扣其違約金，經促請檢討改善，已暫扣廠商該筆款項，並於嗣後與廠商終止契約時，將暫扣違約金轉作扣罰款項，維護市府權益。
臺北市政府於民國(下同)98年7月公告實施臺北市北投士林科技園區開發計畫，期建立生產、生活、生態等功能完整之科技產業園區，新工處為進行上開園區開發作業，於100年8月辦理北投士林科技園區區段徵收公共工程(第1期)(決標金額6億9,770萬元)，並分兩階段施工，第一階段預計於103年4月完工，第二階段預計於104年4月完工；依工程契約規定，逾各該階段期限完工者，應分別計算逾期違約金。臺北市審計處查核發現，該工程第一階段於104年1月始完工，已逾契約規定期限，惟新工處未依約扣罰廠商逾期違約金，經函請檢討改善。
嗣經臺北市審計處追蹤結果，新工處已於104年2月自估驗計價款內暫扣廠商第一階段之逾期違約金6,348萬元，嗣後第二階段工程，廠商因財務問題無法履約而於104年10月終止契約時，該處已將暫扣違約金轉作扣罰款項，維護市府權益。