審計部教育農林審計處 (下稱教育農林審計處) 查核發現，國立臺灣歷史博物館 (下稱臺史博館) 執行「國立臺灣歷史博物館籌建計畫」，未妥訂投標廠商履約能力資格，且疏於控管籌建作業期程，致籌建計畫執行進度延宕，未能如期達成開館目標；復未配合館務運作提供穩定之餐飲服務，影響園區整體營運，經函請檢討改善，業已籌建及招商完竣並提供全區營運服務。
前臺灣省政府為擴大蒐集並安全保存臺灣歷史文物，於民國 (下同) 85年1月提報「臺灣省立歷史博物館籌建計畫書」，規劃於臺南市臺糖公司和順農場興建博物館，基地面積20公頃。嗣於88年7月精省後，由前行政院文化建設委員會(101年5月20日改制為文化部，以下統稱文化部)於88年10月成立國立臺灣歷史博物館籌備處接續興建，96年3月奉准正式成立臺史博館。教育農林審計處查核發現，臺史博館未能及早擬訂分標發包策略及控管設計時程，致部分標案設計作業延宕；復未妥訂投標廠商履約能力資格，致展示教育暨園區景觀新建工程因承包廠商財務危機而終止契約，工程進度落後；另於園區新建工程尚未完竣，先行開放部分空間展示營運，因參訪人數有限，致「引進民間參與國立台灣歷史博物館相關營運委託專業服務」辦理餐廳及輕食區招商屢次流標。雖於100年底改以標租方式招商，惟承租廠商仍因商業利潤考量，提前於102年3月終止契約，未能配合館務運作，穩定提供園區餐飲服務，影響臺灣歷史文化園區之整體營運效能。經函請文化部督促研謀改善。
嗣經教育農林審計處追蹤臺史博館改善結果，園區相關工程均已籌建完竣，並重新招商穩定提供餐飲服務，發揮園區整體營運效能。截至104年底止，已舉辦19場次特展及常設展覽，吸引逾117萬人次入園參觀，充分發揮保存臺灣歷史文物及展示教育之效益。