審計部新北市審計處(下稱新北市審計處)查核發現，新北市果菜運銷股份有限公司(下稱果菜公司)執行農藥殘留檢驗作業，未按相關檢驗規定落實採樣檢驗並銷毀農藥殘留超標之果菜，經函請檢討改善，已增加檢驗人力及調整採樣作業程序，並加強農藥殘留檢驗超標案件列管追蹤機制，保障民眾食用安全及健康。
為加強果菜農藥殘留檢驗並防止農藥殘留量超標之果菜流入市面販售，果菜公司依消費者保護法及農產品批發市場管理辦法規定，訂定果菜公司進場果菜農藥殘留檢驗處理要點，對於每年平均高達20萬餘公噸進場交易之蔬果執行農藥殘留抽樣檢驗，以保障消費者食用安全。新北市審計處查核民國(下同)100及101年度果菜公司執行農藥殘留檢驗作業，發現該公司年度供應量或交易次數前100大供應人(單位)中，分別有24位及26位供應人(單位)，其進場蔬果當月、全年、或連續2年未經農藥殘留檢驗，復以對檢驗結果不合格之案件，未確實追蹤管制並銷毀農藥殘留超標之果菜，有影響民眾健康之虞等情事，經函請新北市政府研謀改善。
嗣經新北市審計處追蹤果菜公司改善結果，該公司負責檢驗部門人力已由87人增加至95人，104年檢驗件數5萬7,078件較103年增加1萬5,420件，並透過設立檢驗查核簿及工作日誌委由交易股股長代為督導，依相關檢驗規定落實採樣檢驗，超標案件經扣留銷毀並拍照之件數，由103年之52件降至104年之6件；另已建立供應人管理措施及加強農藥殘留檢驗超標案件列管追蹤機制，於果菜交易系統建立禁止進貨管制清單，攔截檢驗結果不合格之案件，暫時禁止交易，達成前端及時控管，保障民眾食用安全及健康。