審計部臺北市審計處(以下簡稱臺北市審計處)查核發現臺北市立動物園(以下簡稱動物園)提供經管房地予廠商設置販賣站，部分收益以捐贈方式，提撥為動物認養經費，留存自行運用，未解繳市庫，經審計機關促請臺北市政府教育局(以下簡稱教育局)檢討改善，已調降認養經費提撥比率，調升繳庫金額，增加市庫收入計345萬餘元。
動物園民國(下同)100年度提供園內5區經管房地予廠商設置販賣站，經臺北市審計處查核發現，各該販賣站依契約規定，除收取房地使用費外，並按銷售額比率提撥營業回饋金(3.1％)與動物認養經費(5％至5.1％)。惟動物園僅將使用費及回饋金解繳市庫，至認養經費，則以廠商捐贈方式，留存自行運用於動物保育、研究及教育業務，未辦理繳庫，經函請教育局洽請該府財政局(以下簡稱財政局)釋示並檢討改善。
嗣經臺北市審計處追蹤動物園改善情形，業依財政局101年9月17日函釋，為兼顧市庫收入及動物保育政策，考量該園動物認養經費已穩定成長，研議調增營業回饋金與調降認養經費提撥比率。於102年8月至103年12月間，除2區契約期限未屆外，其餘3區經期滿重新招標簽約，已調降認養經費提撥比率(4％至4.03％)，並調升營業回饋金比率(4.08％至4.21％)，經統計截至104年5月底，增加市庫收入計345萬餘元。