審計部臺北市審計處(以下簡稱臺北市審計處)查核發現，臺北市建築管理工程處(以下簡稱建管處)未依違章建築處理辦法等規定優先拆除影響公共安全之違章建築，經審計機關促請檢討改善，已針對頂樓加蓋第2層、超過3個(含)使用單元及營業性廚房等3類妨礙公共安全之違章建築，專案列管，其中屋頂既存違章建築裝修隔出3個以上之使用單元者，已督促違建戶自行改善完竣，以保障人民生命財產安全。
依違章建築處理辦法第11條之1第1項規定：「既存違章建築影響公共安全者，當地主管建築機關應訂定拆除計畫限期拆除；……。」經臺北市審計處查核發現，建管處民國(下同)98至102年度計編列9億5,616萬餘元預算辦理違建處理業務，惟臺北市轄內占用防火間隔(巷)、開放空間、違章建築樓層達2層以上、屋頂裝修隔出3個以上之使用單元、營業性廚房或妨礙消防安全等違章建築，建管處雖已查報列入優先拆除對象，惟未處理案件仍由98年度初之6,676件，逐年提升至102年10月底之7,816件，不減反增，違章建築處理成效不彰，經函請檢討改善。
嗣經臺北市審計處追蹤建管處改善情形，該處已將前揭未處理違建依行政區分類，交由所轄各拆除區隊優先排訂期程強制拆除；各拆除區隊長於每月召開之違建會報檢討執行情形至全部執行完畢，並就各小隊長執行績效列入年終考核辦理。截至103年12月底止，連同新增之查報案件787件，累計影響公共安全之違建8,603件，已處理6,216件，未處理案件已降至2,387件；其餘案件將持續排定期程拆除，以保障人民生命財產安全。