審計部查核發現，內政部營建署(下稱營建署)訂定衡量污水下水道建設之指標－下水道普及率與污水處理率，依該署公告民國(下同)98至101年全國用戶接管普及率及污水處理率統計一覽表，臺北市及新北市均有普及率或處理率達100％之情形，惟其污水下水道建設仍持續進行中，指標所列數據與事實顯有差異，經促請營建署檢討妥處，該署已檢討修正下水道普及率與污水處理率之計算方式，並納入污水下水道第5期建設計畫，以作為日後檢視政策規劃及執行之依據。
政府污水下水道第2期至第4期建設計畫(自87至103年度止)，均以下水道普及率與污水處理率作為污水下水道建設績效衡量指標，審計部前於查核污水下水道建設第3期計畫，發現營建署訂定公共污水下水道普及率(公共污水下水道已接管戶數/全國總戶數)之計算方式，有關全國總戶數係以每家戶4 人估算，較內政部統計資訊服務網公布每戶3.01人至3.50人(86至97年度)有所偏離，於99年6月2日函請該署檢討下水道普及率統計數據之正確性，嗣審計部再行查核污水下水道第4期建設計畫，發現該署仍未檢討修正相關指標之計算方式，致臺北市與新北市下水道普及率或污水處理率達100％欠合理之情事仍持續存在，乃於102年5月16日再次函請營建署檢討妥處。
案經審計部追蹤營建署後續檢討情形，該署業於污水下水道第5期建設計畫，依內政部戶政司網站公告各市縣總人口數及戶量數，修正下水道普及率與污水處理率之計算方式，原臺北市與新北市存有達100％之不合理情形，已修正改善，截至103年12月31日止，全國公共污水下水道普及率由37.96％修正為26.57％，污水處理率由69.87％修正為48.91％，覈實呈現各市縣施政績效，審計部將賡續注意全國污水下水道建設情形。