臺南市政府農業局(下稱農業局)為強化農村整體發展，辦理農村再生計畫。經審計部臺南市審計處(下稱臺南市審計處)調查發現，該局未積極輔導農村社區參與訓練課程，亦未督促完成訓練之社區確實提報農村再生執行計畫(下稱執行計畫)，致截至民國(下同)102年底，通過執行計畫審查之社區數僅39個，經函請該局檢討改善。該局已積極辦理各項說明會及教育講習等，並請各區公所協助推動農村社區參與相關計畫，截至103年底，全市已有53個農村社區通過農村再生計畫審查。
農業局於98至102年度陸續向行政院農業委員會申請補助計1,115萬餘元，透過公共設施建設、特色宅院整建、生態保育活動及善用社區特色發展觀光等作為，辦理農村再生相關計畫。該計畫推動流程係先輔導各社區完成訓練課程後，賡續提報執行計畫及各年度執行需求，於審查通過後據以執行。經臺南市審計處調查發現，臺南市之農村社區共計429個，其中174個參與相關訓練，約占40.56％，惟部分社區遲延經年未完成訓練課程；或雖完成訓練，卻未賡續提送農村再生執行計畫，或未依規定提報年度執行需求，致截至102年底，通過執行計畫審查之社區數僅39個，經函請該局檢討改善。
嗣經農業局參採改進結果，該局已積極辦理農村再生計畫宣導等多項說明會、座談會、參訪團、觀摩活動及教育講習，並請各區公所協助推動社區參與訓練計畫，且於103年12月13、14日辦理「2014台南農村食創SHOW」，展現農村再生計畫之推動成果；另上開未完成訓練或未提報執行計畫之社區，該局已督促各該社區積極完成訓練，並確實提報執行計畫；復持續輔導及鼓勵社區參與農村再生計畫，103年新增14個社區通過農村再生審查，截至103年底，全市共有53個農村再生計畫社區，積極推廣農村社區生態保育發展特色文化觀光或產業建設。