審計部高雄市審計處（以下簡稱高雄市審計處）查核發現，高雄市動物保護處（以下簡稱動保處）未就已辦寵物登記案件，積極宣導民眾辦理後續異動登記，並加強清查登記資料之正確性，致動物防疫網絡存有闕漏，經函請研謀改善，動保處已加強宣導並全面清查，民國（下同）103年度截至9月底清查比率達99％，確實更新寵物登記資料，強化防疫工作效益。
依寵物登記管理辦法規定，寵物死亡日起1個月內，飼主應向登記機構辦理註銷登記，又據研究文獻顯示，犬隻平均壽命約為10年。經高雄市審計處查核發現，截至102年11月底動保處辦理寵物登記已逾10年者計62,627筆，推估多數犬隻應已死亡，惟該處未研議妥為宣導飼主辦理後續異動登記，且101年及102年針對登記10年以上之犬隻僅分別清查2,368筆及4,366筆，清查比率為3.78％及6.97％，顯有偏低，影響寵物登記資料正確性及防疫工作之推展，經函請檢討改善。
嗣經高雄市審計處追蹤動保處改善結果，該處自103年度起採發布新聞方式，宣導民眾主動通報註銷已死亡之犬隻，並配合偏遠鄉區狂犬病預防注射工作，與當地里長共同推行寵物登記戶口清查宣導，以電話及投遞明信片等方式進行全面清查。經統計截至103年9月底已清查件數計62,004筆，清查比率達99％，較102年度4,366筆增加57,638筆，辦理死亡除戶計52,470筆，比率達84.62％，已積極更新寵物登記資料，健全動物防疫體系，提升防疫效益。