審計機關包括1部8處及15個審計室，審計部設五個廳，與交通建設審計處及教育農林審計處綜理中央機關審計事務；六都分設審計處，與縣市審計室綜理地方政府審計事務。審計機關辦公地點遍佈全省及離島地區，詳如下圖。

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