前臺南縣學甲鎮公所(臺南縣市合併後改制為臺南市學甲區公所)為解決鎮內老舊市場建築物安全問題，研提學甲公有零售市場改建計畫，總經費5,698萬餘元，先後辦理「93學甲鎮公有零售市場修建工程」及「98學甲公有零售市場改建工程」，改建155個攤位區及15間店舖。
經審計部臺南市審計處於民國(下同)101年1月派員調查發現，該公所辦理93市場修建工程，於93年5月28日完工，惟於未取得使用執照前，任令建物違規使用；又辦理98市場改建工程，未妥適審查設計單位法定應行辦理項目，致須停工及數度辦理變更設計，延宕計畫完成期程，又因未取得使用執照，造成整體市場無法使用，閒置逾2年等未盡職責及效能過低情事，經依審計法第69條規定，於101年10月函請臺南市政府查明妥處。
案經審計部臺南市審計處追蹤臺南市政府改善結果，該市場已於102年4月3日取得使用執照，同年5月18日正式營運，截至102年10月底止，已出租店舖15間及攤位153個，出租率達99.4%，並已收取攤鋪位使用費224萬餘元；另該府業檢討於爾後辦理工程時，將事先審慎評估計畫執行可行性，於工程設計時，邀請專業人員協助審查，並充實承辦人員建築法規相關知識。