澎湖縣家畜疾病防治所為落實寵物源頭管理，推動寵物登記業務，經審計部臺灣省澎湖縣審計室查核發現，縣內寵物登記機構僅2處，不利寵物登記業務之推動，經函請研謀改善，已輔導新增1處寵物登記機構，提供民眾近便之寵物登記服務。

　　審計室指出，動物保護法第19條第2項規定，寵物之出生、取得、轉讓、遺失及死亡，飼主應向直轄市、縣(市)主管機關或其委託之民間機構、團體辦理登記；直轄市、縣(市)主管機關應給與登記寵物身分標示，並應植入晶片。該所為加強源頭管理，持續推動寵物登記業務，除輔導特定寵物業者成立寵物登記站外，並配合縣內各項活動辦理政令宣導，輔導飼主落實寵物登記。

　　然而，審計室於115年1月查核發現，據農業部寵物登記管理資訊網公布之澎湖縣寵物登記機構，僅該所及佑青動物醫院2處，登記機構未臻普及，不利寵物登記之推動，審計室遂於115年3月函請該所研謀改善。

　　審計室表示，經追蹤改善情形，截至115年7月底止，已輔導湖光動物醫院辦理寵物登記業務，並簽訂寵物登記機構委託契約，澎湖縣寵物登記機構已增至3處，便利民眾就近辦理寵物登記作業，強化寵物源頭管理機制。