經濟部標準檢驗局（下稱標檢局）於106年成立國家再生能源憑證中心（下稱憑證中心），推動我國再生能源憑證運行及發展，包含受理憑證申請文件審查及現場查核作業，經審計部查核發現，再生能源憑證設備案場申請數量逐年增加，有待現場查核案場數量仍多，且各年度待追蹤查核案場數量差異甚大，經函請研謀改善，已培訓擴增人力及由該局認可之查驗機構辦理，提升查核量能以因應國內需求。
審計部指出，標檢局配合政府淨零及能源轉型政策，成立憑證中心推動我國再生能源憑證運行及發展，依規定憑證中心受理憑證申請後，應辦理文件審查及現場查核，經查核符合規定者，准予發電設備登錄為憑證設備，開始累計電量。截至113年9月底止，憑證中心已核准再生能源憑證設備案場1,353案。
然而，審計部查核發現，憑證中心接獲申請案場數由109年度之49案，增加至113年度之1,920案，截至113年9月底止，尚處審查程序未通過者計有1,093案，逾總申請數量（2,686案）之4成，其中916案仍待進行現場查核，倘按原查核進度估計，約8個月始能完成，審查速度有待提升；又標檢局107至112年度追蹤查核已核准再生能源憑證設備案場後續營運情形，查核數量介於1案至25案不等，恐未能確保各案場之憑證設備有無與其他非再生能源發電設備併聯、電度表準確度符合標準等情事，審計部遂於113年1月及114年1月函請標檢局研謀改善。
審計部表示，經追蹤改善情形，標檢局已培訓所屬分局人員投入辦理案場查核，並於114年5月26日修正再生能源憑證實施辦法第2條等規定，自114年7月1日起由該局認可之查驗機構執行發電設備現場查核，以提升查核量能，因應國內再生能源發展需求。