國防部軍醫局（下稱軍醫局）為提升國軍醫療體系智慧化與資訊整合能力，由三軍總醫院辦理「慧醫專案」，建置醫療影像雲服務及資料中心等，期使國軍醫院有效運用醫療資訊，支持臨床決策、品質管理等，經審計部查核發現，軍醫局未妥為訂定運用資料中心之相關審核機制，經函請研謀改善，已訂頒相關使用規定，提供國軍醫院通用作業依據。
審計部指出，依據慧醫專案計畫書，為符個人資料保護法相關規範，資料中心提供診療、臨床指標、品質管理及資料分析使用，須規劃資料使用機制，經審核後提供使用者進行查詢運用。
然而審計部於112年10月查核發現，國軍醫療體系醫師進行遠端跨院支援影像判讀，或運用資料中心執行資料分析辦理研究計畫，尚無相關資料使用及審核程序，審計部遂於113年1月函請國防部督促研謀改善。
審計部表示，經追蹤改善情形，軍醫局已於113年9月訂頒「軍醫局醫療整合研究資料庫管理作業規定」，設置醫療整合研究資料庫中心管理相關臨床資訊蒐集、儲存及運用等，並訂定相關資料庫使用申請及審查程序，114年4月底已受理16案研究計畫依上述規定申請提供有關醫療資訊，並進行相關審核作業，以符合個人資料保護法相關規範。