基隆市政府(下稱市府)產業發展處(下稱產發處)管理基隆市第二類漁港，經審計部臺灣省基隆市審計室查核發現，部分漁船(筏)漁業執照逾期未依規定申請換發，亦未訂定漁港基本設施使用管理費收費標準，經函請檢討改善，已強化管理漁業證照及公告收費標準，維持漁港管理秩序。
審計室指出，依漁港法、漁業法及其施行細則相關規定，第二類漁港由縣市主管機關管理；經營漁業者應經主管機關核准並取得漁業證照始得出港，核准後逾1年未從事漁業，或未經核准休業逾2年，由主管機關撤銷其核准，如需繼續經營，應於期滿前3個月內申請換發。市府為基隆市第二類漁港主管機關，應妥為管控漁業證照，並依漁港基本設施使用管理費收費類目及費率標準第2條規定訂定收費費率，落實漁港管理。
然而，審計室於113年1月查核發現，產發處轄管外木山、望海巷、長潭里及大武崙等4處第二類漁港，截至112年底止，計有14艘漁業證照逾期未依規定申請換發，部分甚有進出港紀錄，及尚有77艘持有漁業證照之漁船於110至112年間均無進出港紀錄，另未妥為訂定漁港使用管理收費標準等情事，審計室遂於113年4月函請市府檢討妥處。
審計室表示，經追蹤改善情形，市府已於113年5月28日公告實施「基隆市第二類漁港基本設施使用管理費收費類目及費率」，截至113年底止，漁業證照逾期或無進出港紀錄之漁船(筏)，均已由漁業人依規定辦理換發證照，或辦妥休業手續，以有效管控漁業證照，落實漁港管理秩序。