新化果菜市場位於臺南市新化市區中心,於50年初設置,為臺南市重要蔬果集運中心,由臺南市政府(下稱市政府)獨資設立之臺南市農產運銷股份有限公司(下稱農產運銷公司)經營管理,囿於市場腹地不足、建築物老舊、欠缺冷藏設備及拍賣資訊系統等因素,市場機能受限。市政府遂由農業局研提新化果菜市場遷建規劃書,於103年6月報經行政院農業委員會(112年8月1日改制為農業部)核定推動新化果菜市場遷建計畫,遷建經費8億5,100萬元,預定興建果菜市場、交易拍賣系統及冷藏庫等設施,興建期程預計至106年底止,並由農產運銷公司接續營運。其後,農業局分別辦理市場新建工程採購及冷藏庫委託民間投資興建與營運招商,惟該局未妥為規劃用地取得作業,又延誤申請經費補助及未確實辦理用地調查等,導致市場新建工程遲至110年10月始竣工;另冷藏庫委託民間投資興建與營運,因該局事前未與市場攤商達成共識,俟與民間機構簽訂契約後,因遭攤商質疑可能出現壟斷市場等問題,於110年9月終止契約,截至110年11月底止,仍未完成市場遷建作業,執行期程已大幅落後3年11個月。審計機關職司政府財務效能之考核,審計部臺南市審計處(下稱臺南市審計處)為瞭解新化果菜市場遷建計畫執行情形,經規劃辦理專案調查發現有效能過低情事,爰依審計法第69條第1項前段規定函請臺南市市長查明妥適處理,並報告監察院。經臺南市審計處賡續追蹤後續改善結果,新建市場已自111年12月正式營運,有「全國最美果菜市場」美稱,成為臺南市新興觀光遊憩景點;另冷藏庫新建工程已於113年9月完工,未來新化果菜市場結合冷鏈系統,預估每年蔬果調節量達2,000公噸,有助於天災來襲時穩定蔬果價格,保障消費者與攤商權益。